念珠菌属各菌种可引起多种临床综合征，统称为念珠菌病，通常按受累的部位分类。一般说来，最常见的两种综合征为黏膜皮肤念珠菌病(例如口咽念珠菌病或鹅口疮、食管炎和阴道炎)和侵袭性或深部器官念珠菌病(例如念珠菌血症、慢性播散性或肝脾念珠菌病、心内膜炎和内眼炎)。在大多数患者中，念珠菌病为机会感染性疾病。