鳃裂瘘管为鳃囊为鳃沟相通或鳃沟不消失而生成。鳃裂瘘管的外瘘口及全程位于颈部，故又称颈侧瘘管。鳃裂瘘管的形成与以下因素有关：鳃沟与鳃囊间的隔膜破裂；鳃沟闭合不完全；鳃器官上皮残留；鳃器官发育异常；颈窦未闭合。以上一种或几种因素可同时存在。