近年来发现，在健康个体体检中亦发现真菌性鼻-鼻窦炎，表明这些真菌也可以在机体抵御侵袭能力下降的某一局部致病。常见于糖尿病酮症酸中毒、器官移植术后、长期应用糖皮质激素或抗肿瘤药物或广谱抗生素、放疗及HIV病人。致病菌主要为曲霉菌和毛霉菌。 真菌性鼻-鼻窦炎的发病率有上升趋势，可能与抗生素的广泛使用、环境污染有关，也可能由于体检工作普遍开展、影像学的进步使真菌性鼻-鼻窦炎发现率提高。