肺真菌病，是真菌（霉菌）所引起的肺病。从流行病学调查发现人体的真菌感染很多个别地区组织胞质菌、球孢子菌的感染率可高达50％以上，但大多数为亚临床型在短时间内未被发现即自愈。由于广泛应用广谱抗生素治疗感染，抗代谢细胞毒性药物治疗恶性肿瘤器官移植术后应用免疫抑制剂，以及激素的经常应用，特别在数药配合应用（如器官移植后的三联药）情况下，使机体防御功能降低，体内菌群失平衡使原为条件致病菌的真菌侵入人体发病。肺深部真菌感染往往由于吸入各真菌孢子的尘土。肺部真菌感染发病率由于前述各种药物的广泛应用有明显增加。