真菌（霉菌）种类很多，在土壤、植物、禽畜中和人体正常皮肤及黏膜表面都有。从流行病学调查发现人体的真菌感染很多，个别地区组织胞质菌、球孢子菌的感染率可高达50％以上，但大多数为亚临床型，在短时间内未被发现即自愈。近二三十年来，由于广泛应用广谱抗生素治疗感染，抗代谢细胞毒性药物治疗恶性肿瘤，器官移植术后应用免疫抑制剂，以及激素的经常应用，特别在数药配合应用（如器官移植后的三联药）情况下，使机体防御功能降低，体内菌群失平衡使原为条件致病菌的真菌侵入人体发病。肺深部真菌感染往往由于吸入各真菌孢子的尘土。肺部真菌感染发病率由于前述各种药物的广泛应用，有明显增加。肺霉菌病有肺放线菌病、肺曲霉菌病、肺诺卡菌感染等常见类型。真菌病的诊断相当困难，因真菌病多为继发感染，临床上的症状及体征常为原发病的表现。取痰或分泌物做涂片或培养，查到的真菌未必是致病菌。肺放线菌病可用青霉素治疗，肺曲霉球病须用两性霉菌B与氟胞嘧啶联合治疗，肺诺卡菌病以磺胺嘧啶为首选药物。